2002年11月，中国共产党第十六次全国代表大会通过了《中国共产党章程（修正案）》，将下列哪一思想确立为党必须长期坚持的指导思想？

本题考查“三个代表”重要思想的历史地位。党的十六大（2002年）将“三个代表”重要思想写入党章，确立为党必须长期坚持的指导思想。A项邓小平理论是在党的十五大（1997年）确立的；C项科学发展观是在党的十七大（2007年）写入党章，党的十八大（2012年）确立为指导思想；D项新时代中国特色社会主义思想是在党的十九大（2017年）确立的。因此，正确答案为B。